Tes Panel PCR Multipleks untuk Infeksi, 2018
Telah terjadi pertumbuhan dan pengembangan tes molekuler yang ekstensif untuk diagnosis infeksi. Apa yang mendorong pengembangan tes-tes ini adalah banyak dari status penyakit misalnya gastroenteritis, penyakit menyerupai influensa, radang paru-paru (pneumonia), radang selaput (meningitis) dan radang otak (ensefalitis) dan yang lain-lain, bahwa pasien yang datang ke dokter mereka mungkin disebabkan oleh berbagai mikro-organisme. Mengidentifikasi organisme spesifik yang menyebabkan infeksi sering memiliki implikasi terapeutik. Jika itu adalah infeksi virus, penyakit biasanya akan sembuh sendiri dan pasien dapat diyakinkan bahwa dia diharapkan untuk pulih dalam beberapa hari tanpa perlu antibiotik. Sebaliknya, infeksi bakteri boleh berkembang dan mengintervensi lebih awal dengan antibiotik yang tepat akan memperpendekkan jalan penyakit. Sampai saat ini, untuk mendiagnosis secara akurat etiologi radang paru-paru (pneumonia), beberapa sampel dahak (atau sampel penarnapasan) akan dikirim untuk kultur bakteri, kultur virus atau pengujian molekuler virus. Ini akan dikirim ke laboratorium yang berbeda. Waktu perputaran untuk mendapatkan hasil ini mungkin 2-3 hari untuk kultur bakteri, 10-14 hari untuk kultur virus dan 1-3 hari untuk tes molekuler. Ketersediaan tes panel syndromic multiplex telah mula menggantikan banyak apa yang telah dilakukan sebelumnya di beberapa laboratorium mikrobiologi diagnostik. Dengan satu sampel pernafasan yang didapat dengan tepat (dahak, nasofaring aspirate) tes PCR multipleks dapat dipesan untuk apa pun dari 4 hingga hampir 30 tes untuk mencari bakteri yang berbeda, virus atau jamur dan parasit (dalam pengaturan yang sesuai). Sampel akan dikenakan tes amplifikasi acid nukleat (NAT), biasanya dengan polymerase chain reaction (PCR) dalam sistem tertutup. Dengan teknologi yang ditingkatkan, waktu perputaran telah berkurang hingga beberapa jam atau dalam waktu 24 jam setelah penerimaan sampel. Dengan miniaturisasi dan kemajuan teknologi yang lebih lanjut di masa depan, contoh pengujian menggunakan platform PCR multipleks akan tersedia di pengaturan klinik (titik tes perawatan) daripada harus mengirim sampel ke laboratorium yang mungkin “di luar lokasi”.
Sehingga tahun 2017, tes PCR multipleks tersedia di beberapa laboratorium di Singapura untuk infeksi pada saluran pernapasan, saluran cerna dan sistem saraf pusat (untuk radang selaput (meningitis) dan radang otak (ensefalitis)). Tes-tes ini semakin banyak digunakan dalam praktek klinis sehari-hari. Tes “panel multipleks” yang sering kita gunakan adalah sebagai berikut:
Panel Virus : ini biasanya dilakukan pada sampel sputum atau faring dan mencakup hampir 20 virus berbeda yang biasanya menyebabkan infeksi pada saluran pernapasan.
Pneumonia Multipleks PCR: ini biasanya dilakukan pada sampel sputum atau bronchoalveolar lavage dan ia dapat membantu untuk mengidentifikasi Bordetella pertussis, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophilia pneumoniae dan Legionella.
Gastrointestinal PCR: ini dilakukan pada sampel feses dan mencakup mikro-organisme umum yang menyebabkan infeksi pada saluran pencernaan termasuk bakteri, virus dan parasit.
Meningitis / Encephalitis multipleks PCR: Ini dilakukan pada sampel cairan serebrospinal dan digunakan untuk mendiagnosis infeksi sistem saraf pusat (CNS) seperti meningitis dan ensefalitis. Di Singapura, beberapa laboratorium menggunakan PCR tetraplex internal (in-house) mereka sendiri dan yang lain menggunakan kit PCR multipleks komersial yang mencakup banyak bakteri, virus, dan jamur.
Di masa depan, tes PCR multipleks komprehensif diharapkan akan tersedia di Singapura untuk diagnosis infeksi seksual menular, infeksi tulang dan sendi dan demam pada wisatawan/traveller yang kembali.
Penting untuk memberikan beberapa komentar peringatan tentang penggunaan dan peluncuran tes-tes ini. Pertama, mereka memang mahal tetapi memiliki keuntungan menggunakan satu sampel untuk menargetkan beberapa organisme yang berpotensi menggantikan sebagian dari biaya beberapa sampel yang dikirim ke laboratorium yang berbeda.
Dalam kasus infeksi bakteri, kerugian lain (disadvantage) adalah bahwa tes PCR multipleks ini mungkin tidak memberikan hasil kerentanan (yaitu tes yang menentukan antibiotik mana yang tepat untuk dipilih). Beberapa tes dalam panel ini memberikan informasi tentang penanda genetik resistensi antibiotik dalam sampel dan dapat memberikan beberapa panduan dalam pemilihan antibiotik. “Panel Pneumonia Rumah Sakit” yang baru-baru ini diperkenalkan akan dapat mendeteksi 21 bakteri, 1 jamur dan 19 penanda resistensi obat dan biaya untuk tes tunggal ini akan lebih dari SGD1000. Ketiga, tes ini sangat sensitif dalam mendeteksi virus, bakteri dan kadang-kadang jamur. Dengan peningkatan sensitivitas tes semacam itu, kekhawatiran telah dikemukakan tentang interpretasi dan tes positif palsu. Individu mungkin dijajah oleh bakteri tertentu dan dapat juga menumpahkan beberapa virus tanpa gejala, tanpa kehadiran penyakit serius. Penjelasan lain yang mungkin dari tes positif palsu termasuk “kontaminasi” dari sampel yang terkumpul.
Tes PCR multipleks akan menjadi lebih umum digunakan untuk diagnosis infeksi. Untuk infeksi seperti radang paru-paru (pneumonia), tes PCR multipleks telah meningkatkan pemahaman kita tentang epidemiologi diperoleh komunitas radang paru-paru (pneumonia). PCR multipleks akan meningkatkan akurasi diagnostik kami dan dalam kasus penyakit demam karena virus, ini akan memperbolehkan dokter untuk menahan penggunaan antibiotik dalam banyak hal.